１月１日 日本が国際連合安全保障理事会の非常任理事国になる（１１回目）。
１月４日 国の行政機関でマイナンバー（個人番号）の利用がはじまる。
１月２９日 日本銀行がマイナス金利政策を導入することを決定する。
２月４日 日本政府がTPP（環太平洋戦略的経済連携協定）に署名する。
２月１１日 重力波が初めて検出されたことが発表される。
３月２５日 京都丹波高原国定公園が指定される。
３月２６日 北海道新幹線の新青森・新函館北斗間が開業する。
３月２７日 民主党，維新の党などが合流して民進党が結成される。
３月２９日 安全保障関連法が施行される。
４月１４日 熊本県でマグニチュード６.５，最大震度７の地震が発生する。この後も地震がくり返し起こる（熊本地震）。
４月１６日 熊本県でマグニチュード７.３，最大震度７の地震が発生する。これが熊本地震の本震とされる。
５月２６日 第４２回サミットが三重県の伊勢志摩で開催される。
５月２７日 バラク・オバマ米大統領が広島市を訪問する。
６月１９日 選挙権年齢を「１８歳以上」とする改正公職選挙法が施行される。
６月２３日 イギリスで行われた国民投票で，イギリスのEU（ヨーロッパ連合）離脱を支持する票が過半数を超える。
７月１０日 第２４回参議院議員通常選挙が行われる。
７月１６日 トルコで軍の一部がクーデターをおこすが失敗する。
７月１７日 国立西洋美術館（東京都台東区）をふくむ「ル・コルビュジエの建築と都市計画」が世界文化遺産に登録される。
８月５日 第３１回夏季オリンピックがブラジルのリオデジャネイロで開幕する。
８月１１日 新たな祝日「山の日」。
９月１５日 やんばる国立公園（沖縄県）が指定される。
１０月３日 大隅良典・東京工業大学名誉教授がノーベル医学生理学賞を受賞する。受賞理由は「オートファジーの仕組みの解明」。
１１月８日 アメリカの大統領選挙で，ドナルド・トランプ候補（共和党）の当選が決まる。
１１月３０日 日本で発見された１１３番元素の名称が正式にニホニウム（元素記号Nh）に決定する。